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Name Modified Size InfoDownloads / Week
Readme.md 2018-11-13 1.2 kB
Human20180927CON.fasta 2018-11-13 13.8 MB
ProDistiller.1.25_win.zip 2018-11-13 21.3 kB
Totals: 3 Items   13.8 MB 0

2018/11/7 11:23:37

Author: WU Songfeng

Maintainer: CHANG Cheng

v1.25(改编自ProDistiller.1.24.33.2.pl

  1. Wu: 对代码进行检查和修改。蛋白装配改为调用merge_group.v2.4.demo.pl(之前是v2.2)。2.4是一个针对大数据不会溢出的版本
  2. Chang:在Linux上运行此程序处理CNHPP数据时发现有bug,进行debug。同时进行程序的优化和重写. 不再要求ProDistiller程序与PepList文件在同一个目录下
  3. 在最后调用FormPepList_20181106.pl,处理蛋白质控之后的结果,重新写成PepList文件
  4. 上传代码至SourceForge: https://sourceforge.net/projects/prodistiller/

ProDistiller的使用

ProDistiller共有4个perl脚本,保证4个脚本在同一文件夹下

用法: 切换到ProDistiller程序所在文件夹下,运行如下命令:

示例:

  • perl ProDistiller.1.25.pl -d E:\work\CNHPP\Human20180927CON.fasta -PSM 0.01 -PEP 0.01 -p D:\cnhppIPX0001234002\IPX0001234000peplist
Source: Readme.md, updated 2018-11-13