Name | Modified | Size | Downloads / Week |
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Readme.md | 2018-11-13 | 1.2 kB | |
Human20180927CON.fasta | 2018-11-13 | 13.8 MB | |
ProDistiller.1.25_win.zip | 2018-11-13 | 21.3 kB | |
Totals: 3 Items | 13.8 MB | 0 |
2018/11/7 11:23:37
Author: WU Songfeng
Maintainer: CHANG Cheng
v1.25(改编自ProDistiller.1.24.33.2.pl)
- Wu: 对代码进行检查和修改。蛋白装配改为调用merge_group.v2.4.demo.pl(之前是v2.2)。2.4是一个针对大数据不会溢出的版本
- Chang:在Linux上运行此程序处理CNHPP数据时发现有bug,进行debug。同时进行程序的优化和重写. 不再要求ProDistiller程序与PepList文件在同一个目录下
- 在最后调用FormPepList_20181106.pl,处理蛋白质控之后的结果,重新写成PepList文件
- 上传代码至SourceForge: https://sourceforge.net/projects/prodistiller/
ProDistiller的使用
ProDistiller共有4个perl脚本,保证4个脚本在同一文件夹下
用法: 切换到ProDistiller程序所在文件夹下,运行如下命令:
- perl ProDistiller.1.25.pl -d<fasta文件路径> -PSM 0.01 -PEP 0.01 -p<PEPLIST文件目录>
示例:
- perl ProDistiller.1.25.pl -d E:\work\CNHPP\Human20180927CON.fasta -PSM 0.01 -PEP 0.01 -p D:\cnhppIPX0001234002\IPX0001234000peplist