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ProDistiller.1.25_win.zip (21.3 kB)
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| Name | Modified | Size | Downloads / Week |
|---|---|---|---|
| Readme.md | 2018-11-13 | 1.2 kB | |
| Human20180927CON.fasta | 2018-11-13 | 13.8 MB | |
| ProDistiller.1.25_win.zip | 2018-11-13 | 21.3 kB | |
| Totals: 3 Items | 13.8 MB | 0 |
2018/11/7 11:23:37
Author: WU Songfeng
Maintainer: CHANG Cheng
v1.25（改编自ProDistiller.1.24.33.2.pl）
- Wu: 对代码进行检查和修改。蛋白装配改为调用merge_group.v2.4.demo.pl（之前是v2.2）。2.4是一个针对大数据不会溢出的版本
- Chang：在Linux上运行此程序处理CNHPP数据时发现有bug，进行debug。同时进行程序的优化和重写. 不再要求ProDistiller程序与PepList文件在同一个目录下
- 在最后调用FormPepList_20181106.pl，处理蛋白质控之后的结果，重新写成PepList文件
- 上传代码至SourceForge: https://sourceforge.net/projects/prodistiller/
ProDistiller的使用
ProDistiller共有4个perl脚本，保证4个脚本在同一文件夹下
用法： 切换到ProDistiller程序所在文件夹下，运行如下命令：
- perl ProDistiller.1.25.pl -d<fasta文件路径> -PSM 0.01 -PEP 0.01 -p<PEPLIST文件目录>
示例：
- perl ProDistiller.1.25.pl -d E:\work\CNHPP\Human20180927CON.fasta -PSM 0.01 -PEP 0.01 -p D:\cnhppIPX0001234002\IPX0001234000peplist