[Samtools-help] Errors when compiling the samtools

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Hi,

I am trying to compile samtools on my computer. But an error always happens
and says "bam_tview.c:5:20: error: curses.h: No such file or directory". I
tried samtools-0.1.16 and samtools-0.1.15. The same error message showed up.

My computer is running SuSe Linux Enterprise Server. The arch is x86_64.

The following shows the compiling process:

david@linux-eg:~/Utilities/samtools/samtools-0.1.16> make
make[1]: Entering directory `/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16'
make[2]: Entering directory `/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16'
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bgzf.c -o bgzf.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. kstring.c -o kstring.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_aux.c -o bam_aux.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam.c -o bam.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_import.c -o bam_import.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. sam.c -o sam.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_index.c -o bam_index.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_pileup.c -o bam_pileup.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_lpileup.c -o bam_lpileup.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_md.c -o bam_md.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. glf.c -o glf.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. razf.c -o razf.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. faidx.c -o faidx.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bedidx.c -o bedidx.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. knetfile.c -o knetfile.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_sort.c -o bam_sort.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. sam_header.c -o sam_header.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_reheader.c -o bam_reheader.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. kprobaln.c -o kprobaln.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_cat.c -o bam_cat.o
ar -cru libbam.a bgzf.o kstring.o bam_aux.o bam.o bam_import.o sam.o
bam_index.o bam_pileup.o bam_lpileup.o bam_md.o glf.o razf.o faidx.o
bedidx.o knetfile.o bam_sort.o sam_header.o bam_reheader.o kprobaln.o
bam_cat.o
make[2]: Leaving directory `/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16'
make[2]: Entering directory
`/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16/bcftools'
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. bcf.c -o bcf.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. vcf.c -o vcf.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. bcfutils.c -o bcfutils.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. prob1.c -o prob1.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. em.c -o em.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. kfunc.c -o kfunc.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. kmin.c -o kmin.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. index.c -o index.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. fet.c -o fet.o
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I.. -I. bcf2qcall.c -o bcf2qcall.o
ar -cru libbcf.a bcf.o vcf.o bcfutils.o prob1.o em.o kfunc.o kmin.o index.o
fet.o bcf2qcall.o
make[2]: Leaving directory
`/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16/bcftools'
make[2]: Entering directory
`/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16/misc'
make[2]: Nothing to be done for `lib'.
make[2]: Leaving directory
`/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16/misc'
gcc -c -g -Wall -O2  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE
-D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 -I. bam_tview.c -o bam_tview.o
bam_tview.c:5:20: error: curses.h: No such file or directory
bam_tview.c:7:2: warning: #warning "_CURSES_LIB=1 but NCURSES_VERSION not
defined; tview is NOT compiled"
bam_tview.c:418:2: warning: #warning "No curses library is available; tview
is disabled."
make[1]: *** [bam_tview.o] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/david/Utilities/samtools/samtools-0.1.16'
make: *** [all-recur] Error 1

Any comments and suggestions are welcome. Thanks in advance.

David Li
Bloomberg School of Public Health
Johns Hopkins University