私は、Adobe Illustratorを所有していないので、確認することはできませんが、IllustratorのPDFに関する機能はIllustratorファイルをPDF形式で保存ができるというように考えたほうがよいようです。ちなみに、日本語を含んだ通常のファイル（Microsoft Word文書など）から、Adobe社以外のPDFプリンタで作成した場合も同様のエラーが発生することが知られています。日本語フォントを変える（CJKフォント vs TrueTypeフォントの埋め込み）と解決するという話もある様ですので、そこら辺を試してみてください。
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たびたび質問させていただきます．
pdfファイルに，ページ番号（日本語含む）をiTextdotNETで追加し保存するとacrobatreaderではちゃんと読めるのですがillustratorでは，ファイルには再解析をおこなったpdfオブジェクトが含まれています．
と表示され，表示できなくなってしまいます．
これを回避する方法はありますでしょうか？
私は、Adobe Illustratorを所有していないので、確認することはできませんが、IllustratorのPDFに関する機能はIllustratorファイルをPDF形式で保存ができるというように考えたほうがよいようです。ちなみに、日本語を含んだ通常のファイル（Microsoft Word文書など）から、Adobe社以外のPDFプリンタで作成した場合も同様のエラーが発生することが知られています。日本語フォントを変える（CJKフォント vs TrueTypeフォントの埋め込み）と解決するという話もある様ですので、そこら辺を試してみてください。
ありがとうございます．