Buenos días
La presente es para solicitar ayudo para correr el docking flexible.
Smina acepta archivo de configuración como vina y autodock ?
Estoy tratando de hacer un docking flexible con el siguiente archivo de configuración pero no me genera resultados.
receptor = 3aicFH.pdbqt flex = flex.pdbqt ligand = ACR-ct-manual.pdbqt center_x = 194.05 center_y = 42.996 center_z = 195.375 size_x = 46 size_y = 50 size_z = 48 out = 3aicA-ACR-ct-smina-flex-out.pdbqt exhaustiveness = 8 num_modes = 10 log = log-ct-3aicA-ACR-smina-flex.txt
Gracias por su atención
Can you explain what you mean by not getting results? You need to pass --out_flex if you want to see the changes to the flexible part of the receptor.
Eso pasaba, si generaba resultados pero no me imprimia los resultados de la parte flexible del receptor .
Gracias, problema solucionado
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Buenos días
La presente es para solicitar ayudo para correr el docking flexible.
Smina acepta archivo de configuración como vina y autodock ?
Estoy tratando de hacer un docking flexible con el siguiente archivo de configuración pero no me genera resultados.
receptor = 3aicFH.pdbqt
flex = flex.pdbqt
ligand = ACR-ct-manual.pdbqt
center_x = 194.05
center_y = 42.996
center_z = 195.375
size_x = 46
size_y = 50
size_z = 48
out = 3aicA-ACR-ct-smina-flex-out.pdbqt
exhaustiveness = 8
num_modes = 10
log = log-ct-3aicA-ACR-smina-flex.txt
Gracias por su atención
Can you explain what you mean by not getting results? You need to pass --out_flex if you want to see the changes to the flexible part of the receptor.
Eso pasaba, si generaba resultados pero no me imprimia los resultados de la parte flexible del receptor .
Gracias, problema solucionado