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R2Web c'est quoi ?

Un logiciel en ligne pour les statistiques pour la médecine, basé sur R. Le logiciel open source R permet de faire un grand nombre d'analyses statistiques. Avec R2web, seules les fonctions R utiles aux étudiants en médecine sont présentes, dans une version web avec une interface qui facilite le travail de l'étudiant (en remplaçant les lignes de commande sous R par des cases à cocher, des boutons radio, etc).

Concepteurs et financeurs

Développé par Yannick Darcy à partir d'un cahier des charges rédigé par Jean-Luc Bosson (UJF, CHU Grenoble), Muriel Ney (CNRS), Claudine Schwartz (UJF) et Alexandre Moreau-Gaudry (UJF), démonstrateur gracieusement hébergé par Christophe Ney / Pole33.

Financé en partie par la région Rhône-Alpes (projet CIBLE), l'UJF (Université de Grenoble) et l'UNF3S (Université Numérique Francophone des Sciences de la Santé et du Sport)

Comment l'installer ?

Un fichier INSTALL.TXT est inclus dans les sources. Il faut installer R et les librairies utiles sur un serveur php.

Comment démarrer ?

Un démonstrateur est disponible sur http://r.tel-laboratorium.fr (contactez l'un des membres ci-dessous pour obtenir le mot de passe)

Il faut d'abord importer un fichier excel (bouton sur le menu de droite) contenant des données en lignes et en colonnes. La première ligne donne le nom de chaque variable (en colonne).

Project Members:

• Christophe Ney (admin)
• Muriel Ney (admin)

Les fonctionalités

Enregistrement des traces pour les étudiants (onglet historique)

Fonctions de base :
Importer (NA quand il y a une donnée manquante)
Exporter le fichier initialement créé sous excel puis modifié sous R2web
Modifier le contenue d’une cellule dans le tableau de données importé
Recoder les données

Statistiques descriptives :
Moyenne
Ecart type (standard deviation)
Ecart-type de la moyenne (standard error of the mean)
Nombre de cas et le nombre de cas manquants
Minimum
Maximum
Variance
Coefficient de variation
Etendue (range)
Médiane
Quantiles : quartiles, déciles et percentiles

Graphiques (téléchargeables sous forme d’images jpg)

Analyses univariées :
· Histogramme nombres
· Histogramme pourcentages
· Diagramme en bâtons
· Diagramme en secteurs
· Boxplot
· Tableau nombres et pourcentages
· Tableau fréquences cumulées

Analyses bivariées :
· Tableau de contingence nombres
· Tableau de contingence pourcentages totaux
· Tableau de contingence pourcentages lignes
· Tableau de contingence pourcentages colonnes
· Bi-plot lignes
· Bi-plot points
· Histogramme éclaté nombres
· Boxplot éclaté

Tests :
Test t de student
Test du chi deux
Test exact de Fisher
Test de Mann-Whitney, rangs de Wilcoxon
ANOVA (un ou deux groupes)

Corrélations :
· Coefficient de corrélation de Pearson
· Coefficient de corrélation de Spearman
· Régression Linéaire

Statistiques en santé :
Calculs des odds ratio et risques relatifs
Calculs des spécificités et sensibilités avec valeurs prédicatives positivités et négatives
Analyse de survie (un ou deux groupes)