Re: [PyMOL] Help - how mutation affects protein structure

[Marco S. <se...@un...>]

Dear Susanna,

in addition to MD calculations I suggest you to perform a check on your 
mutated protein. Circular dichroism is a simple technique that allows to 
monitor the global fold of your protein.

Mutating a residue may affect the folding and this seems an 
underestimated problem in the literature.

Best,

Marco Sette

Il 12/04/2022 16:34, susanna pagni ha scritto:
> Hello,
>
> I am quite new to PyMOL. I would like to assess how an amino acid change might affect the protein structure. I used the Wizard Mutagenesis to change the amino acid of interest but don’t know how I can see how the protein structure is affected by the mutation.
>
> Can you please help me with this?
>
> Many thanks in advance.
>
> Best wishes,
> Susanna
>
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Dr.Marco Sette, Ph.D.
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