I am making tube representations as a comparison between two structures.  I have the rmsd in the b-factor field.  
1)  If I do a putty representation it works.  How does the program decide on the width variation of the tube?
2)  How can this be reset? 
 I want to do this so when I compare two different rmsd plots the width of lets say 1 rms is the same in both figures.

Any help would be apprecipated.
Evan R. Kantrowitz, Ph.D                                                                  evan.kantrowitz@bc.edu
Boston College                                                                                   Tel. 617-552-4558
Department of Chemistry                                                                  FAX 617-552-2705                                      
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