https://sourceforge.net/p/populationmodel/wiki/Home/Recent changes to HomeenMon, 21 Sep 2015 12:37:33 -0000https://sourceforge.net/p/populationmodel/wiki/Home/<div class="markdown_content"><pre>--- v3 +++ v4 @@ -1,4 +1,4 @@ - + Программа работает в среде MS DOS (используйте DosBox с русификатором russian.txt). Если работает очень медленно или зависает, откройте параметры (F4) и измените Delay на 1. Также, можете дополнительно изменять количество циклов DosBox (Ctrl+F11 / Ctrl+F12). </pre> </div>Alexey ArkhipenkoMon, 21 Sep 2015 12:37:33 -0000https://sourceforge.net8175abdb7f26370e2a8ae7a19d4c5e4fa36b41f6https://sourceforge.net/p/populationmodel/wiki/Home/<div class="markdown_content"><pre>--- v2 +++ v3 @@ -1,3 +1,4 @@ + Программа работает в среде MS DOS (используйте DosBox с русификатором russian.txt). Если работает очень медленно или зависает, откройте параметры (F4) и измените Delay на 1. Также, можете дополнительно изменять количество циклов DosBox (Ctrl+F11 / Ctrl+F12). </pre> </div>Alexey ArkhipenkoMon, 21 Sep 2015 12:37:11 -0000https://sourceforge.netcc8b535ee280787b54c863d666ceb2054d6f42bfhttps://sourceforge.net/p/populationmodel/wiki/Home/<div class="markdown_content"><pre>--- v1 +++ v2 @@ -1,8 +1,223 @@ -Welcome to your wiki! - -This is the default page, edit it as you see fit. To add a new page simply reference it within brackets, e.g.: [SamplePage]. - -The wiki uses [Markdown](/p/populationmodel/wiki/markdown_syntax/) syntax. +Программа работает в среде MS DOS (используйте DosBox с русификатором russian.txt). +Если работает очень медленно или зависает, откройте параметры (F4) и измените Delay на 1. Также, можете дополнительно изменять количество циклов DosBox (Ctrl+F11 / Ctrl+F12). + +Cодержание справки: + 1. Управление программой + 2. Структура файлов экосистем + 3. Уравнения и модели + 4. Замечание об ошибках + 5. Источники + + +1. Управление программой: + + В режиме выбора и редактирования экосистемы: + F1 - Вызов этой справки + F4 - Редактирование параметров выбранной экосистемы или смена + описания папки + F5 - копирование выбранной экосистемы + F6 - перемещение выбранной экосистемы + F7 - создание новой папки + Ins - создание новой экосистемы + Del - удаление папки/экосистемы + BkSp - возврат в предыдущую папку + Enter - переход в режим моделирования и создание графика числен- + ностей для выбранной экосистемы + + В режиме моделирования экосистемы: + Esc - Возврат в режим выбора и редактирования + Enter - Продолжение моделирования с начала экрана + P - Приостановка моделирования + Tab - Включение / выключение вывода параметров моделируемой + экосистемы. + При нажатии любой клавиши кроме Enter и P моделирование начина- + ется с начала (с начальных параметров) + + +2. Программа содержит несколько уравнений моделирования популяций. В файлах + экосистем номер экосистемы является самым первым параметром (Tip). + В поставляемых экосистемах после заголовка следуют уравнения дан- + ного Tip'a. Если вы создаете свой файл, то нужно следовать следу- + ющим правилам: + 1. Последовательность параметров должна быть всегда определен- + ной: Tip, время (T1 и T2), максимальная отображаемая числен- + ность (MaxY), начальные количества каждой популяции (No1, + No2,..), специальные параметры экосистемы. К специальным па- + раметрам (также в определенной последовательности) относят- + ся коэффициенты, подставляемые в уравнения динамик популя- + ций. + 2. Название перед каждым параметром необязательно, но перед каж- + дым должен стоять знак равенства иначе данная строка рассмат- + ривается как комментарий. + 3. Комментарии (в том числе пустые строки) можно вводить с любом + месте файла, начиная с новой строки. Если вы хотите ввести + комментарий, содержащий знак равенства (уравнение), то нач- + ните строку со знака "&gt;". + + +3. Каждому Tip'у соответствует определенный набор уравнений динамики числен- + ностей популяций экосистемы, количество популяций и параметров: + 1. Модель Мальтуза. Элементарная модель экспоненциального неог- + раниченного роста одной популяции. + Популяции: 1 + Уравнения: dN=k*N + Параметры: k + Пример: 1\MALT + 2. Модель с учетом конкуренции за пищевой ресурс (1 типа). Поз- + воляет моделировать два типа экосистем: вымирающие при недо- + статочном размножении и стабилизирующиеся. R - среднее коли- + чество потомков, родившихся от одной особи, k - коэффициент + шага моделирования. + Популяции: 1 + Уравнения: dN=N*(R*Exp(-N)-1)/k + Параметры: R, k + Примеры: 1\COMP1\* + 3. Модель существования двух видов без учета конкуренции за пи- + щевой ресурс (на основе предыдущей). Коэффициенты а и b отве- + чают за характер и силу влияния видов друг на друга. Напри- + мер, a=-0.02 и b=0.001 описывает систему "хищник-жертва", + причем жертвой является первый вид. + Популяции: 2 + Уравнения: dN1=k1*N1+a*N1*N2 + dN2=k2*N2+b*N1*N2 + Параметры: k1, a, k2, b + Примеры: 2\HZ\SIMPLE\* + 4. Модель существования двух видов с учетом внутривидовой конку- + ренции за ресурс (1 тип). На основе модели N 2. + Популяции: 2 + Уравнения: dN1=N1*(R1*Exp(-N)-1)/k1+a*N1*N2 + dN2=N2*(R2*Exp(-N)-1)/k2+b*N1*N2 + Параметры: R1, k1, a, R2, k2, b + Примеры: 2\HZ\COMP1\* + 5. Модель существования двух видов с учетом внутривидовой конку- + ренции за ресурс (2 тип). На основе модел N 3. При моделиро- + вании экосистемы "хищник-жертва" при отрицательном собствен- + ном приросте хищника (k), т. е. хищник погибает без жертвы, + можно не учитывать ресурс для хищника (0), поскольку он уже + фактически введен в виде жертвы. (см. также модель N 8) + Популяции: 2 + Уравнения: dN1=k1*N1+a*N1*N2+r1*N1^2 + dN2=k2*N2+b*N1*N2+r2*N2^2 + Параметры: k1, a, r1, k2, b, r2 + Примеры: 2\HZ\COMP2\* + 2\COMP\* + 6. Модель существования трех видов без учета внутривидовой конку- + ренции за ресурс. На основе модели N 3. Добавлено еще несколь- + ко параметров взаимодействия, чтобы охватить все 6 связей, ко- + торые могут существовать между 3 видами. + Популяции: 3 + Уравнения: dN1=k1*N1+a1*N1*N2+b1*N1*N3 + dN2=k2*N2+a2*N1*N2+b2*N2*N3 + dN3=k3*N3+a3*N1*N3+b3*N2*N3 + Параметры: k1, a1, b1, k2, a2, b2, k3, a3, b3 + Примеры: 3\HZ\SIMPLE1\* + 3\HZ\SIMPLE2\* + 7. Модель существования трех видов с учетом внутривидовой кон- + куренции за ресурс. На основе моделей NN 5 и 6. + Популяции: 3 + Уравнения: dN1=k1*N1+a1*N1*N2+b1*N1*N3+r1*N1*N1 + dN2=k2*N2+a2*N1*N2+b2*N2*N3+r2*N2*N2 + dN3=k3*N3+a3*N1*N3+b3*N2*N3+r3*N3*N3 + Параметры: k1, a1, b1, r1, k2, a2, b2, r2, + k3, a3, b3, r3 + Примеры: 3\HZ\COMP1\* + 3\HZ\COMP2\* + 3\COMMEN\* + 8. Модель существования одного вида с учетом внутривидовой кон- + куренции за ресурс (2 типа). Ресурсный коэффициент должен + обязательно быть ниже нуля. Чем он больше по модулю, тем ни- + же будет численность вида в стационарном состоянии. + Популяции: 1 + Уравнения: dN=k*N+r*N^2 + Параметры: k, r + Примеры: 1\COMP2\* + 9. Модель малых отклонений от числа инфицированных и восприимчи- + вых к инфекции организмов популяции. g определяет смертность + в популяции. R определяет заразность заболевания. Фактически + за все время болезни возбудитель передается от одного инфици- + рованного в среднем R членам. b характеризует выздоровление + инфицированных членов. w - отклонение от числа инфицированных + в стационарном состоянии, v - отклонение от числа восприимчи- + вых в стационарном состоянии. На основе модели N 10. + Популяции: 1 (2) + Уравнения: dw=g*(R-1)*v + dv=-g*R*v-b*w + Параметры: g, R, b + Примеры: EPIDEMY\SIMPLE\DELTA\* + 10. Модель распростронения заболевания в некоторой популяции. + Сделаны следующие допущения: иммунитет пожизненный, числен- + ность популяции в сумме не меняется, популяции паразита и + хозяина однородны, вероятность смерти индивида не зависит от + возраста, вероятность выздоровления и передачи инфикции не за- + висит от времени. Кроме того, допущено, что при малой дли- + тельности заболевания инфицированные члены популяции не уми- + рают. При моделировании строятся 3 графика численностей инфи- + цированных, восприимчивых и невосприимчивых членов популяции + хозяина. a характеризует заражение восприимчивых членов, + b - выздоровление инфицированных (и их переход в невосприим- + чивых), g - смертность членов. I - численность инфицированных + членов, S - численность восприимчивых членов. См. также + модель N 9. + Популяции: 1 (3) + Уравнения: dI=a*I*S-b*I + dS=-a*S*I+g*(1-S) + Параметры: a, b, g + Примеры: EPIDEMY\SIMPLE\* + 11. Модель, аналогичная модели N 10, но также учитывающая периоди- + чески меняющуюся вероятность передачи инфикции. На экран вы- + водится только численность инфецированных членов популяции. + Популяции: 1 (2) + Уравнения: dI=a*I*S-b*I + dS=-a*S*I+g*(1-S) + a=Ao+A*Sin(w*T+f) + Параметры: Ao, A, w, f, b, g + Примеры: EPIDEMY\PERIOD\* + 12. Модель заболеваемости инфекцией. Построена на основе модели + N 11, но на экран выводится не численность инфицированных чле- + нов популяции, а число заболевших за единицу времени (в виде + доли от общего числа организмов в популяции), т.е. a*Ni*Ns + Популяции: 1 (3) + Уравнения: dI=a*I*S-b*I + dS=-a*S*I+g*(1-S) + a=Ao+A*Sin(w*T+f) + Параметры: Ao, A, w, f, b, g + Примеры: EPIDEMY\ZARAZH\* + + +4. В программе использована специальная многоуровневая система контроля + ошибок. Поэтому практически ничто не может самопроизвольно завер- + шить программу без желания пользователя. Если в модель были введе- + ны неестественные коэффициенты, то результат может выйти за пределы + (0.5e4932). В этом случает программа выдаст звуковой сигнал и оста- + новит моделирование, поскольку никаких разумных результатов все равно + уже нельзя будет получить, исходя из данных параметров. После нажа- + тия клавиши программа вернется в меню и выдаст сообщение об ошибке, + предлагая пользователю продолжить работу. Отказываться от продолже- + ния работы имеет смысл только в том случае, если программа цикличес- + ки выдает данную ошибку уже несколько раз и не продолжает работу. Та- + кое в принципе возможно только в случае грубых физических повреждений + компьютера или изменений программы в результате занесения вируса или + попыток изменения кода. Если программа обнаружит заражение вирусом, + она попытается излечить себя с разрешения пользователя, если это ока- + жется возможным. + + +5. При составлении программы многие уравнения были заимствованы из следую- + щих источников: + 1. А.Н.Герасимов, "Математические модели в биологии, экологии и + медицине. Москва, МИФИ, 1998 + (Модель NN 1, 2, 3, 4, 9, 10, 11, 12) + 2. А.О.Рувинский, Л.В.Высоцкая, С.М.Глаголев и др., "Общая биоло- + гия". Москва, "Просвещение", 1993 + (Модель N 5) + + +Со всеми вопросами и предложениями просьба обращаться: + e-mail: rualark@gmail.com + + Архипенко Алексей + Москва + 1999 [[members limit=20]] [[download_button]] </pre> </div>Alexey ArkhipenkoMon, 21 Sep 2015 11:53:31 -0000https://sourceforge.netdeee02b36c06f2bc0dca92527cacb19c7f5996afhttps://sourceforge.net/p/populationmodel/wiki/Home/<div class="markdown_content"><p>Welcome to your wiki!</p> <p>This is the default page, edit it as you see fit. To add a new page simply reference it within brackets, e.g.: <span>[SamplePage]</span>.</p> <p>The wiki uses <a class="" href="/p/populationmodel/wiki/markdown_syntax/">Markdown</a> syntax.</p> <p></p><h6>Project Members:</h6> <ul class="md-users-list"> <li><a href="/u/rualark/">Alexey Arkhipenko</a> (admin)</li> </ul><br/> <p><span class="download-button-55ffef27c4d10444c80f8587" style="margin-bottom: 1em; display: block;"></span></p><p></p></div>Alexey ArkhipenkoMon, 21 Sep 2015 11:51:03 -0000https://sourceforge.net877d9e4388a93076c55c62fcf2535e2232fe4309