[Joelib-help] Darstellung / Fehler in SMARTS-Matching (?)

[Andreas M. <ma...@in...>]

Hallo Joerg,

1) unter 

http://www.informatik.uni-freiburg.de/~maunza/screenshot.jpeg 

gibt es eine Darstellung eines Molekuels mit gematchtem SMARTS mithilfe von JOELib.

SMILES ist "OC1C(O)C(CO)OC1N2C=CC(=N)NC2=O"
SMARTS ist "O=O=c:n:c:c:c:n-C-O-C-C-C-O"

Nach Meinung meines Kollegen C. Helma duerften die mit Pfeilen markierten Kanten
*nicht* rot eingefaerbt werden. Trifft das zu (bin selber kein Chemiker)?

2) zwei weitere Fragen zur gewuenschten chemischen Darstellung:

Kann man die Darstellung der Kohlenstoffe ("C") und der mit
ihnen verbundenen Wasserstoffe ("H") ausschalten - sie sollten
sich implizit aus den Ecken ergeben?

Kann man aromatische Ringe nicht als alternierende Einfach- und
Doppelbindungen (Kekule-Schreibweise, derzeitige Darstellung)
sondern durch einen Kreis in ihrer Mitte darstellen?

Viele Gruesse,

Andi