#5 Analiza dywergencji

[J K]

Analiza dywergencji - identyfikacja pozycji które są zmienne lub nie w dwóch (lub więcej) wybranych grupach sekwencji. W to wchodzi nie tylko sprawdzenie identyczności, ale także i charakterystyka miejsc podobnych według np. BLOSUM62.

Filogenetyczna analiza dywergencji - identyfikacja miejsc j.w. które są zgodne z konkretnym drzewem filogenetycznym. Tutaj analiza będzie trochę bardziej złożona, ale nic ultra szalonego. Drzewko powinno być zadane przez użytkownika, ale można by też zaimplementować jakiś prosty algorytm rekonstrukcji filogenetycznej, np. Neighbour-joining. Bardzo fajnych dodatkiem byłoby tutaj narysowanie topologii drzewa przy nazwach sekwencji.